本尊は薬師如来ですが、愛染寺という名前の通り、愛染明王をお奉りしているお寺です。移転前に金沢にあった「愛染院」のご本尊は「愛染明王」と言われており、これが愛染寺の名前の由来となっています。

　愛染明王は人間の愛欲を司り、縁結びに力のある仏様とされています。この愛染明王を本尊としている護摩堂では、縁結びの護摩祈祷が行われています。