『出雲国風土記』にも登場し、出雲大社に次ぐ出雲二の宮と言われる古社です。大社造を３殿並べて建てられた珍しい本殿（重文）があります。この神社は10月の神在月に神様が出雲大社に集まり縁結びの会議を行った後、後半（旧暦10月20～25日）はこちらに移動して会議の続きを行います。この第２会議のための準備に行われるのが９月24日夜の『御座替(ござがえ)神事』で、神様の会議を邪魔しないようにと境内を静寂に保つのが『お忌祭り（神在祭）』です。

　また佐太神社の約100mほど東には、摂社の田中神社があります。この神社も歴史が古く、『出雲国風土記』にその名を見ることができます。前後に並ぶ２つの社殿が互いに背を向けた珍しい形式で、西社は木花開耶姫命（このはなさくやひめのみこと）を祀り、縁結びと安産に、東社は磐長姫命（いわながひめのみこと）を祀り縁切りと長寿にご利益があります。